一位中年患者来“一笑堂”看病，德福刚要诊脉，被喜来乐制止了，患者十分奇怪，连说给你们送钱来了，你们干嘛不要呢?
孟庆和来到“一笑楼”，想请喜来乐到他的药铺挂牌坐诊，当即遭到拒绝，孟庆和不甘心失败，以二十两银子要一个菜刁难喜来乐，喜来乐凭着自己的聪明才智将孟庆和戏弄了一番。
为给喜来乐捧场，陈皮带了几十人来“一笑楼”吃饭，胡氏见自己忙不过来，叫跑堂的德福匆匆上了几个不干不净的现成菜，见食客们不悦，陈皮忙向大家讲述起喜郎中先前对众人的恩德，食客们连连称是。
喜来乐从陈皮口中得知，赛西施与田魁翻脸后回沧州来了，心情顿时开朗了许多。德福拿来一个药方，认准师傅去祁州行医了，胡氏连连追问，玉儿看出了破绽，喜来乐觉得有人冒名顶替，决定去祁州查个究竟。
路上，喜来乐师徒见到了被假喜来乐治死的病人，心中十分气愤。他让德福化装成孕妇，来到假“一笑堂”，当众揭露了假喜来乐的骗局。
神医喜来乐分集介绍 第三十二集县衙大堂上，真假喜来乐使出全身本领极力证明是真喜来乐，昏庸的县太爷不由分说，在孟庆和的鼓惑下，将真喜来乐师徒上枷戴锁，示众三天，却将假喜来乐当堂释放。
喜来乐师徒被绑在街头示众，百姓们指着他们痛骂。赛西施回到沧州，设法救下了喜来乐师徒。“一笑楼”内，胡氏与赛西施正在谈论田魁，田魁便到了，赛西施当着众人的面，揭露了田魁卖友求荣，将喜来乐救助鲁正明的事告发的行径，田魁恼羞成怒，言称赛西施如不依从他，就叫她守一辈子活寡，胡氏见此情况，挺身而出，当众答应让喜来乐娶赛西施进门。神医喜来乐分集介绍 第一集
晚清的沧州，虽不及京城繁华，每逢年节或集日也呈现出热闹的景象。这日，几个汉子抬一不省人事的男人四处求医，“一笑堂”药铺的老板喜来乐闻讯赶来，一针下去，生命垂危的男人便醒转过来，围观的百姓连连地称他为神医。
喜郎中被人称为神医，自己却患有惧内的顽症——他念念不忘对门“食为天”饭馆赛西施亲手做的“铁狮子头”。不幸的是，他的这一嗜好让夫人胡氏
察觉了。为了吃“铁狮子头”，喜郎中私藏了自己行医挣来的银两，又被十分爱他且醋意十足的胡氏如数索去。
喜来乐与徒弟德福着实过了把瘾。为支付吃“铁狮子头”的费用，师徒俩使尽了浑身解数，无意之中得罪了在“食为天”恭候皇室御医王天和的沧州药商孟庆和，同时，也冲撞了康有为的弟子鲁正明。
神医喜来乐分集介绍 第二集正在“食为天”与同伴商议国事的鲁正明见送菜人是陌生人，登时拔出笔对准了喜来乐的咽喉。当喜郎中从容地道出鲁正明的伤情及各自不同的疗法后，众人对他深深佩服。店小二对喜来乐的夸奖，让欲往靖王府为格格治病的王天和十分不快，他恣意寻衅，将喜郎中嘲讽了一番。
喜来乐对赛西施向来有情，赛老板嘴上尖刻，内心也有意于喜来乐，二人单独交谈时，被胡氏当场撞见，依然以罚跪搓板惩戒喜郎中。
吃了王天和开的中药，格格的病情并无好转，鲁正明却特意来到“一笑堂”活动着日益渐好的胳膊连称与喜郎中有缘，并建议喜来乐去京城靖王府为格格治病。胡氏对鲁正明邀请她去京城游览十分高兴，又担心自己离开沧州后，喜来乐又去找赛西施，本想让老头子陪她同去，喜郎中却道出了又一番道理。
神医喜来乐分集介绍 第三集鲁正明向靖王举荐喜来乐为格格治病，王爷摇了摇头，并未看中这位来自民间的“土郎中”。
面对胡氏做的饭菜，喜来乐难以下咽，徒弟知道师傅的心思，特意为他买来了“铁狮子头”，筷子未动，又被胡氏发现，将一顿美味倒进了鸡食盆里，喜来乐见此状况，痛心疾首。
王天和再次为已不能服药的格格治病。王爷无奈，决定将喜来乐召进王府，王天和不怀好意地从中阻挠。“一笑堂”里，前来求治的“蛇头疮”孟庆和正在接受医治。喜郎中历来痛恨专卖假药坑骗病人的孟庆和，德福更是恨透了孟庆和，在为孟庆和抓药时做了手脚。沧州知县的小妾秋云素与赛西施要好，无意中发现了赛老板对喜来乐情有独钟。福晋见格格久病不愈，命鲁正明前往沧州召集喜来乐进京，王天和的谋士卢忠心怀鬼胎，先行来找喜来乐，极尽威胁，阻止喜郎中为格格治病。
神医喜来乐分集介绍 第四集赛西施怒从中来，责骂喜来乐将“铁狮子头”不是喂了鸡就是喂了像卢忠一样的“狗”。喜来乐一时解释不清，同时，他又不敢去见前来找他的鲁正明，深怕让他进王府为格格治病。万般无奈，喜来乐被赛西施藏进了自己的卧房，正在得意之时，被前来寻夫的胡氏看见，将他拖下床来。
落魄书生田魁路经“食为天”饭馆，捡起孟庆和的西洋狗都不吃的肉吃了起来，孟庆和大怒，当即要了十碗米饭硬逼迫田魁当场吃下，眼见田魁要被米饭撑死，喜来乐、赛西施想方设法将田魁救下。自以为受尽侮辱的田魁缓过劲来，不由分说，抄起棍棒追打喜来乐，得知真情后，对喜郎中等人感激万分。
格格病情日益加重，王爷听说王天和已经无药可治，下了最后的决心，绑也要将喜来乐绑至京城。孟庆和病情加剧，发觉自己吃的药里有泻药，率人来“一笑堂”问罪。
神医喜来乐分集介绍 第五集喜来乐以毒攻毒，为凑足田魁进京考试的盘缠，将一个作为药引子的鸡蛋以二十两银子的价格卖给了孟庆和。卢忠获悉鲁正明要来沧州请喜郎中进京为格格治病，急忙与孟庆和密谋，不惜用任何手段加以阻止。孟庆和深知上了喜来乐的当，以诈骗的罪名将喜郎中告到了县衙。
喜来乐据理力争，县太爷差人抱来喜郎中的母鸡当堂查验后，将喜来乐师徒押进了监牢。胡氏前来探望喜来乐，喜来乐念念不忘“铁狮子头”，胡氏骂也骂了，到底还是走进了“食为天”饭馆。赛西施来到县衙门，借助秋云解救喜来乐，秋云念在姐妹情分上欣然允诺。秋云突然病倒了，点名要喜郎中医治，县太爷惊慌失措，忙请喜来乐为自己的小妾诊脉。
神医喜来乐分集介绍 第六集喜来乐轻而易举地就为秋云治好了“病”，秋云趁热打铁，提到了喜来乐与赛西施的亲事，见他二人言不由衷，秋云只能摇头叹息。县太爷见秋云放走了喜来乐，刚欲责怪，被秋云一阵抢白，也只好默认了。
孟庆和受卢忠指使，不甘心喜郎中被放出县衙，他用名贵药材贿赂赵知府后，又将状子递到了知府大堂。知府堂上，板子刚打在喜来乐身上，赵知府突然接到一封急信，登时对喜郎中转变了态度，言称靖王爷要喜来乐进京为格格治病。喜来乐犯了犟脾气，死活不去靖王府，赵知府见无法向王爷交令，只好用囚车将喜来乐师徒俩押送进京。
为格格把脉后，喜郎中见其确实不能进药，斗胆向王爷提出了让格格脱光衣服的疗法。
神医喜来乐分集介绍 第七集王庆和诬称喜郎中的治法为妖邪之术，极力阻止其为格格施治，福晋见格格病情日益加重，同意按喜来乐的法子试一试。依照喜来乐所说，天明鸡叫时，格格就会醒来。长夜难眠，喜来乐师徒二人焦灼不安，王天和与卢忠深怕格格醒来，如坐针毡。远在沧州的胡氏，丫环玉儿和赛西施也在为喜郎中捏着一把汗。
在靖王府，德福发现格格的丫环瑞芯患有疾病，同师傅一起为其诊脉开药，瑞芯十分感激，并对德福产生了爱慕。
格格终于醒来了，王天和、卢忠面带愧色悄悄溜走。鲁正明来向喜来乐深表感谢，庆幸自己为王爷推荐了一位神医。王爷高兴之余，欲设宴答谢为格格治病的每一个人。听说王天和推说身体不适，当即命人前去邀请。
神医喜来乐分集介绍 第八集酒席宴上，喜郎中经不住众人撺掇，讲起了为格格治病的妙处，当看见王天和、卢忠也来赴宴，自觉有些张狂，连忙煞住了话头。
王爷赏赐喜来乐之后，要其留在王府效力，鲁正明也有此意，喜来乐婉言谢绝，连称自己治好格格的病是瞎蒙的。王天和、卢忠十分嫉恨喜郎中，喜来乐看在眼里，心中有数，深知治好格格的病会使自己更危险，与德福以探望格格为名欲逃出靖王府。二人正欲出门，碰上了送客的王爷和鲁正明，又被拦了回来。鲁正明看出了喜来乐的心思，并将自己的担心告诉了王爷，当即为喜来乐撑腰。
慈禧太后看戏之间，看到了大病初愈的格格，询问后得知沧州神医喜来乐医术不凡，忙吩咐李莲英记下，便于日后有用。王天和闻言，立刻在太后面前进谗。
神医喜来乐分集介绍 第九集孟庆和得知喜来乐治好了格格的病，厚着脸皮来王府找喜来乐套近乎，想与他联手经营，遭到喜郎中的奚落。
为达到将喜来乐撵出京城的目的，王天和不怀好意地邀请喜来乐到太医院与众太医切磋医术。太医们个个神情傲慢，像审问犯人一样戏弄喜来乐。师徒二人不卑不亢，—一应对，太医们细细品味之后，连连赞扬。
王天和见状，又提起喜来乐用一个鸡蛋诈骗二十两银子的旧事。喜来乐反唇相讥，当众揭露了王天和伙同孟庆和贩卖假药的勾当……
王爷再次挽留喜来乐，答应他让吏部给他谋个五品的官衔。喜来乐执意要回沧州老家，仍说治好格格的病是“瞎猫撞上了死耗子”，言谈之间，喜来乐连称王天和是有真才实学的御医。
神医喜来乐分集介绍 第十集王爷见喜来乐执意要回沧州，只好命人准备饯行酒。鲁正明听说喜来乐果真要走，想尽计策欲将其留下。
德福与瑞芯在交往中关系甚密，在同师傅离京之前，把“一笑堂”自制的美颜膏送给了心上人。
喜来乐离京之前，王爷与鲁正明领他来到王府的藏书楼，喜来乐被满屋子的医书深深吸引，贪婪地看了起来，见此状况，王爷把藏书楼的钥匙交给了喜来乐，终于留住了神医。德福听说师傅不回沧州了，心里乐开了花。
喜来乐留在了京城，王天和心里颇不是滋味，又与卢忠暗地里商量如何将喜来乐师徒二人赶出京城。在喜来乐的家乡，胡氏接到老头子托人捎来的镜子、手帕和法国香水十分得意，马上喷上香水到“食为天”饭馆里炫耀，万没想到，赛西施也收到了一份同样的礼物，胡氏的醋劲立刻上来了。
神医喜来乐分集介绍 第十一集惯于吃醋的胡氏令丫环玉儿将喜来乐捎来的镜子挂到门外，以独特的方式发泄心中的愤恨。
京城的大栅栏里，“一笑堂”已然到了上梁的当口，田魁赶来庆贺，道明自己考了个进士，却并未受到朝廷的重用，喜来乐由衷地哀叹：进士都不值钱了，大清朝还剩什么值钱呢?
靖王爷拥护变法维新，因鼻血流淌不止，有碍前去与德国人谈判，特意叫喜来乐医治，喜郎中真不含糊，用一个民间土方使靖王爷止住了鼻血，靖王爷再次对他刮目相看了。
“一笑堂”在京城竣工，开业在即，王天和、卢忠却不甘寂寞，伺机报复喜来乐。瑞芯无意中听说卢忠要火焚“一笑堂”，卢忠察觉后，对瑞芯进行了威胁。瑞芯受自己良心的支使，专程于夜间请喜来乐师徒吃饭，喜郎中百般谢绝，瑞芯诚心邀请，喜来乐师徒终于听从了瑞芯的安排。
神医喜来乐分集介绍 第十二集幸免于难的喜来乐师徒二人由衷感谢瑞芯姑娘的救命之恩，从中也悟出了“大火烧醒一场梦”的道理。喜来乐坚持要回沧州老家，鲁正明尽力劝阻，道明大老爷们儿，宁可让人打死，也不能让人吓死，喜来乐茫然了。
沧州药贩陈皮从京城返回沧州，将喜来乐师徒被大火烧死的误传告诉众人后，胡氏、赛西施哭得死去活来。沧州的“一笑堂”内专门设置了灵堂，并排摆放着两口棺材，焚香祭奠之时，德福来到了“一笑堂”，令众人惊恐万分，待德福道明原委后，一家人反悲为喜，马上要到京城内与喜来乐团聚。
胡氏醋劲未减，刚刚奉命进入京城，便责问喜来乐是否在京城拈花惹草，喜郎中被弄得哭笑不得。喜来乐在北京开设的“一笑堂”终于开张了，喜郎中本不愿与身为皇室御医的王天和争个高下，王天和却不容不让。英国医生史密斯来京城的“一笑堂”观光，参观之后深有感触。
神医喜来乐分集介绍 第十三集“一笑堂”内，前来求治的病人络绎不绝，喜郎中师徒忙得不亦乐乎。一直未能生养的胡氏来到京城后，觉得自己的肚子渐大，还特别喜欢吃酸的，便洋洋得意起来，喜来乐为她诊脉后，让她先去去肚子里的油水。
王天和嫉贤妒能，千方百计地排挤喜来乐和他的“一笑堂”。喜来乐师徒应史密斯之邀，来到英国医生开的诊所，史密斯向他们讲述了人体的骨骼、内脏等医学常识，使喜郎中对自己从事的医疗工作有了突破性的认识。他与史密斯认真切磋中医疗法，史密斯对中医的博大精神大为赞赏，高兴之余，将一套动手术的医疗器械赠送给喜来乐。
神医喜来乐分集介绍 第十四集赛西施托陈皮特意捎来亲手做的“铁狮子头”，喜来乐睹物思人，感慨万千。胡氏为丈夫做好了猪肉炖粉条，见他久久不来用饭，前来看个究竟，一见又是“铁狮子头”，不由得醋意大发，硬逼着德福将其全部吃掉。
田魁身体不适，来到“一笑堂”看病，言说自己怀才不遇，喜来乐为人十分热心，将田魁举荐给鲁正明，为他设法谋求官职。
受王天和、卢忠的指使，几条汉子抬一黑胖男人来到了“一笑堂”，喜郎中把脉询问过后，便知此人来者不善，他灵机一动，令德福取过史密斯赠送的手术器械，一边张罗着为胖男人开刀，一边描述用刀子划开肚皮的景象，装病的男人吓得爬起来抱头鼠窜了。
喜来乐始终惦念赛西施，借机向食欲不振的王爷推荐了沧州的“铁狮子头”。
神医喜来乐分集介绍 第十五集赛西施搬到京城，又引起胡氏的不悦，她绝没想到又和“食为天”成了对门邻居，气恼之下，将喜来乐为赛老板写的菜单撕得粉碎。
经鲁正明推荐，田魁当上了刑部枢密，特来答谢喜郎中等人。胡氏不准他们去“食为天”进餐，硬是强留田魁在家里吃她做的四喜丸子。珍妃病了，皇上派人召王天和进宫，王太医素闻太后不喜欢珍妃，怕引来是非，祸及自身，故托病未去，皇上大怒，只得听从王爷主张，召喜来乐为珍妃治病。喜郎中一家忙坏了，挑拣像样的衣裤，演习晋见皇上的大礼……
王天和存心不良，深怕喜来乐为珍妃治好病后受到皇上的宠幸，来到“一笑堂”威胁喜郎中，声称若为珍妃治病，惹怒了老佛爷，准会吃不了兜着走。喜来乐被吓傻了……
神医喜来乐分集介绍 第十六集喜来乐一家以扔铜板的方式决定是否进宫治病，结果只得认命。珍妃有病，实际上是老佛爷打的伤痕，喜郎中怕治好珍妃的伤会得罪老佛爷，未开药方，只开了个菜单：蛋白绿豆羹，白切豆腐片，并请皇上派人到“食为天”饭馆去取，意在让赛西施也进宫见见皇上和娘娘。喜来乐的两道菜治好了珍妃娘娘的伤，皇上龙颜大悦，将自己穿的黄马褂赏赐给喜郎中。
王天和借着为太后看病的机会，把喜来乐为珍妃治伤的事告诉了老佛爷，又在众太医面前拨弄是非，引起众太医不满，吵吵嚷嚷要辞职回乡。德福趁喜来乐不备，穿起黄马褂招摇过市，白吃白拿，引起了众人的纷纷议论，却又敢怒不敢言。
神医喜来乐分集介绍 第十七集太后听说众太医欲辞职回乡，怪怨皇上不该为个妃子赏赐黄马褂，为了安抚人心，当即传话将黄马褂赏给众太医们每人一件。
德福自不量力，带着自己心爱的瑞芯在大街上耀武扬威，卢忠看在眼里，暗中打定了主意。沧州的赵知府一行地方官员听说喜来乐得到皇上赏赐的黄马褂，立马前来京城朝拜。喜来乐一时找不到被徒弟偷穿走的黄马褂，情急之下，只好将德福小时用过的屁股帘子摆在案头之上，不料惹下了祸端。
顺天府在卢忠密告后，抓住了德福，当即传喜来乐当堂对质。黄马褂的来历虽经证实，顺天府又以喜来乐用屁股帘子充当黄马褂为罪名，将师徒二人打入死牢。鲁正明坐在大堂上，非但不与喜来乐开脱罪责，反而煽风点火，试图把案子搞大，主张将此案送至刑部严加处置。
神医喜来乐分集介绍 第十八集王天和得知喜郎中犯有欺君之罪，暗自高兴，他写了一幅白色挽联，差卢忠送给死牢中的喜来乐。喜郎中接到挽联，更感觉到世道的险恶以及王太医的用心，且从挽联的字体中，察觉到王天和患有清窍失灵的病症。
鲁正明来到“食为天”遭到赛西施的唾骂。但当赛老板知道鲁正明“欲纵先擒”的用意后，转怒为喜了。见赛西施要去牢里看望喜来乐，鲁正明嘱咐她切不要泄露天机，意让这对沧州来的师徒反省反省。
牢中，赛西施来为喜来乐“送行”，喜来乐料到自己已死到临头，终于说出了多年积聚在心里的真心话，赛西施听后，心中暗暗高兴。衙役将喜来乐师徒押上囚车，二人吓得乱了方寸，听说将案子转呈刑部处置，喜郎中乐了。
神医喜来乐分集介绍 第十九集大堂之上，刑部尚书急着去陪老佛爷看戏，便将喜来乐的案子交付田魁处置，田魁自然不忘喜郎中的恩德，令当差的将德福轻轻打了二十大板后，就将他们释放了。喜来乐对鲁正明的救命之恩万分感谢，并为自己误解了鲁大人而自责。
大难不死，喜来乐夫妇与众人聚在“食为天”庆贺，席间，有人提到了喜来乐在死牢里说出的“真心话”，喜来乐极力回避，胡氏却坚持刨根问底，见喜来乐不敢认账，吞吞吐吐，赛西施着实恼了，端上来一盘猪心、驴肝、狗肺给喜来乐享用。胡氏追问喜来乐在死牢中对赛西施究竟说了什么话，对丈夫的解释十分不满，吓得喜来乐不得不将原话收回，并对胡氏许下了三桩誓愿。
神医喜来乐分集介绍 第二十集胡氏听到喜来乐在发誓中又提到了“铁狮子头”，气不打一处来，忙叫丫环玉儿拿来棍棒，德福见状，一把夺过，声称自己代师娘责打师傅。胡氏走后，德福在一大麻包上狠打起来，惹得胡氏气愤不已，罚师徒二人一起跪搓板。被喜来乐的懦弱伤透了心的赛西施，将喜来乐送给她的镜子等物扔在地上。
老佛爷豢养的巴儿狗取名富贵，多少天来不吃不喝也不叫，这可急坏了李莲英。王天和来到太后面前，诋毁喜来乐不配给人看病，只配当个兽医。太后闻说，忙差李莲英把富贵抱到“一笑堂”治病。喜郎中见抱来的是一条狗，又见王太医寻来众太医看他为狗治病，深知是王天和将自己比做兽医，心中非常气愤。他将计就计，借助李莲英的淫威，言明只有让太医们当场学狗叫，富贵的病才能好起来。众太医无奈，只得从命。
神医喜来乐分集介绍 第二十一集众太医耐着性子学狗叫，丝毫未能引起巴儿狗的同情，照样缄默不语，喜郎中急了，悄悄告诉德福一条妙计。富贵到底叫唤了，叫得李莲英心花怒放，王天和等人却满脸阴沉。
老佛爷召见喜来乐，喜郎中如数家珍地讲了一大堆民间土方，令太后大为高兴。“食为天”饭馆里，赛西施热情款待田魁，并在众人哄闹之下，与田大人喝了个交杯酒，众人喝彩助兴，喜郎中却拔脚离去。
喜来乐在京城出了大名，就连京城有名的鞋帽店老板也知道喜来乐的大名。喜郎中的鞋子的尺寸被鞋店记录在案，正如喜来乐所言，他是“头顶马聚源，脚踩内联升，身穿瑞蚨祥，腰缠四大怕。”
神医喜来乐分集介绍 第二十二集人出了名，脚也成了“贵脚”，内联升的伙计专门送来了为喜郎中特制的“朝靴”，喜来乐对此并无兴趣。
鲁正明带着田魁来“食为天”酬谢赛西施，田大人早对赛西施有意，特意给赛老板买了一副耳环。
饭桌上，鲁正明以烧饼和芝麻为例，讲述了朝廷将台湾割让给日本的行径。众人听罢，齐声痛骂李鸿章。事有凑巧，偏偏李鸿章让喜来乐前去看病。喜郎中借着看病之机，畅快淋漓地数落了李鸿章。众人正在夸奖喜来乐为百姓出了一口怨气，一位不开眼的日本公使在“一笑堂”前下了车……
神医喜来乐分集介绍 第二十三集喜来乐对日本人深恶痛绝，见此人来治牛皮癣，吩咐德福将院里的拴马桩戳到了“一笑堂”门前。日本公使感到受了侮辱，不肯依从喜来乐的治法，由于浑身奇痒无比，只好脱光了上衣在拴马桩上蹭来蹭去，使围观的百姓笑得前仰后合。
赛西施听说喜来乐为日本人治病，气就不打一处来。弄明喜郎中的真正用意后，对喜来乐更加敬重。赛西施约喜来乐到京城白云观许愿，喜郎中自然应允。偏巧胡氏也要在同一时间去白云观烧香。喜来乐无可奈何，只得两头应酬。
一位老妈子随小姐来“一笑堂”看病，喜郎中稍一摸脉就看出了端倪。
神医喜来乐分集介绍 第二十四集小姐未婚先孕了，喜郎中设身处地为其着想，小姐与老妈子深深感谢喜来乐的恩德。
提督大人在对日作战中为国捐躯，喜来乐在鲁正明引见下为提督夫人治好了病，不收分文。
喜来乐与胡氏成亲十多年来未曾生过一男半女，王爷在鲁正明那里得知这一情况后，认定喜郎中的医术不能后继无人，决定亲自干预喜来乐的婚事。王爷叫来了赛西施，赛老板当即表露了心迹。胡氏被王爷召来循循开导，听明原委，醋意又发，王爷急了，让她选择是接赛西施进“一笑堂”还是喝下从西洋引进的“毒药”。胡氏毫不犹豫地喝起了“毒药”，见此状况，王爷也没招了。
神医喜来乐分集介绍 第二十五集沧州一带瘟疫流行，皇上寝食难安，派太医前去赈灾除疫，王天和却以御医为庶民治病不合朝廷律条为由，不肯前去。皇上在靖王爷的举荐下，派喜来乐前望沧州。王天和得知后，生怕喜来乐治好瘟疫再度扬名，不情愿地来到沧州。
孟庆和与王太医早有串通，贩卖劣质药材自然不能消除沧州的瘟疫。
赛西施痛感喜来乐对自己又爱又不敢爱，毅然摘掉“食为天”的牌匾欲回老家。喜来乐多方解释，赛西施不为所动。
沧州的瘟疫久治无效，朝廷大为光火，遂派喜来乐前忘沧州，喜来乐师徒认定名不正则言不顺的道理，向王爷讨来了圣旨和尚方宝剑，在知府大堂上一本正经地演练起来。
神医喜来乐分集介绍 第二十六集王天和窥见喜来乐师徒借着演练痛斥自己，登时翻了脸，赵知府上堂见上面坐着喜来乐，心中十分气恼，当他们看到圣旨与尚方宝剑时，一下子又全蔫了。
喜来乐见王爷到来，心里宽松了许多，声言作为朝廷钦差大臣，不能没有官服，王爷当即令王太医、赵知府脱衣摘帽成全了喜来乐。喜郎中当堂打扮，坐在堂上发号施令，当众惩治了专贩假药的孟庆和，又令王天和去查对沧州地界共有多少口水井，王太医莫名其妙，但又不得不听从钦差大臣的号令。
瘟疫终于被治住了，皇上召见喜来乐，又要赏赐黄马褂，喜来乐想起上次因黄马褂惹出的是是非非，连忙叩头谢绝。
赛西施心灰意冷，决心解散“食为天”，发放银两让手下人各归故里。秋云劝她不要一棵树上吊死，言谈之中提到了一直爱慕赛西施的田魁。
神医喜来乐分集介绍 第二十七集太后召见喜郎中，对他为珍妃治伤并未怪罪，老臣们腿脚不利索，太后责令喜来乐为他们调治。喜来乐用民间土方，以搓衣板加之中草药搓脚足疗的方式，使老臣们解除了各自的病痛。史密斯对此深加赞赏，太后也万分喜悦，将洋人送给她的汽车赏给了喜郎中。
赛西施关了“食为天”饭馆，让喜来乐闷闷不乐。鲁正明前来，责怪喜郎中不该为昏庸的老臣们治好了腿脚，言说太后就是要重用这帮老臣，维新变法的事全让喜郎中搅乱了。喜来乐哀叹，这哪里是治病，整个一个玩权术啊。
神医喜来乐分集介绍 第二十八集喜来乐遵从王爷之命，为假装生病的袁世凯看病，医术不凡，见风使舵，深得袁世凯的赏识。王天和又将喜来乐为袁世凯治病的事告诉了太后，引起太后对靖王爷的不满。
田魁与赛西施成亲的帖子送到了王爷、喜来乐等人的手中，喜郎中不由得暗中伤感。王天和居心叵测，非要在田魁与赛西施的婚宴上看喜来乐的笑话。婚宴上，王天和、卢忠想方设法让喜来乐难堪，喜来乐心绪不佳，终于醉倒到桌子下面去了。
袁世凯派兵捉拿维新派，鲁正明被追兵追赶，逃到了喜来乐的门上。
神医喜来乐分集介绍 第二十九集胡氏绝不相信鲁正明会遭此大难，当鲁正明讲明原委后，胡氏连忙为其凑足了盘缠。
官府前来搜查，被藏在药缸里的鲁正明心惊胆战，情急之下，喜来乐亮出黄马褂，解了燃眉之急。惊魂未定，又一位上了年纪的官员到“一笑堂”搜捕鲁正明，当听到药缸内存放的是为自己搓脚用的药水时，便一笑了之了。
王天和得到卢忠的密报，召来田魁询问鲁正明的下落。“六君子”就义后，王太医更加紧了对田魁的追问。喜来乐一家惊恐之下，逃出了京城。
神医喜来乐分集介绍 第三十集喜来乐在回乡的路上，深感到黄马褂给自己惹下的祸根，在一口水井边，欲将其沉入井中，却遭到当地人的责骂，当知道喜来乐的身份后，连忙将一家人迎到了村子里。
喜来乐回到沧州，深得军民的拥戴，在“一笑堂”即将重振雄风之时，喜郎中用斧头劈碎了“一笑堂”的牌匾，又砸烂了药柜，药秤，立誓再不以悬壶济世为业，他伤透了心。
“一笑堂”更名为“一笑楼”，喜郎中的药铺变成了饭馆，令前来恭贺开张的人们惊诧不已。胡氏做饭的手艺欠佳，令来“一笑楼”吃饭的人大为不满。
卢忠率人来抓捕喜来乐，被沧州守城的官兵拒之门外。
神医喜来乐分集介绍 第三十三集喜来乐与赛西施终于成亲了。未等上床安歇，官兵前来抓走了喜来乐。王天和见抓到了喜来乐，心中得意洋洋，逼迫他公开宣布，治好格格的病是蒙的，给王爷止住了鼻血是抄人家的偏方，止住沧州的瘟疫蔓延是偷他王太医的招数，不然就要喜来乐的性命。
为搭救喜来乐，赛西施再次找到田魁，田魁趁机要挟。太后需要调养，提到了沧州的喜来乐，田魁借机让喜郎中去了京城。喜来乐见到老佛爷，诊治期间，劝她不要生气，须静心调养，老佛爷听从喜来乐的劝告，言称再不去管变法的事了。老佛爷欲赏赐喜郎中，喜来乐不求赏赐，只请老佛爷恕他无罪。
神医喜来乐分集介绍 第三十四集袁世凯在进京途中，被鲁正明用炸弹炸伤，鲁正明在被捕之前，吞吃了砒霜。田魁提出让喜来乐去拯救鲁正明，倘若将人救活，鲁正明招出了同党，喜郎中就可以将功折罪了。鲁正明为掩护同伴，央求喜来乐将自己治死，认定今天纵然被治好，来日也要被拉到菜市口杀头。
胡氏见喜来乐在为鲁正明煎的药里下了雄黄，提醒丈夫这是要治死人的。喜来乐横下一条心，强忍悲痛将煎好的药捧给了鲁正明。
鲁正明死了，袁世凯大怒，王天和鼓动袁世凯一定要查明鲁正明的死因，并找来了鲁正明所服汤药的药渣。胡氏明白，要想救出喜来乐，除非自己去顶罪，遂上堂声称自己故意害死了鲁正明，并说出了一番理由。案子有了结果，田魁欲放喜来乐，王太医当场阻拦。
神医喜来乐分集介绍 第三十五集(大结局)喜来乐刚被释放，胡氏便喝下“三步倒”死在了堂上，喜来乐扑倒在堂上，悲痛欲绝。在王天和的煽动下，喜来乐等人未能免罪，被朝廷发配至黑龙江服苦役。
转眼到了1912年，喜来乐、赛西施带着孩子们来祭奠胡氏。喜来乐在妻子坟前，跪着搓板，思绪万千。
王太医病入膏肓，卢忠肯求喜来乐救其一命。喜来乐出于仁义，来到王天和榻前为其治病，仍以民间土方救了王太医。王天和得知救自己命的汤药是喜郎中开的，立刻心火上攻，发誓死了也不吃他的药，药碗摔碎了，王太医也一命呜呼了。
京城内，“一笑堂”和“食为天”的生意红红火火，历经磨难后，喜来乐和赛西施露出了发自内心的微笑。(全剧终)