刑部尚书提审周新，周新提出传办案之人讯问，余人杰被带至公堂，周新看到他满身是伤，余人杰畏惧没说实话，周新要和他当堂对证，吴之问在堂上不敢说话，周新被上了枷锁后押入大牢。周夫人见到纪钢后要见周新一面，还跪在地上求他，纪纲让人将她扶走。小榔头和雪雁在街上看到抓他的告示，回家时他听到屋里有声音，进门后见到思琪和周夫人。
段无极在大牢中对周新用刑，周新并不屈服，他在刑具面前晕了过去，周新一直坚持他的信念。纪纲来到诏狱指责段无极对周新用刑，段无极只好命人将周新弄到一旁休息。纪纲在周新面前假装好人，周新清楚纪纲明白一切，只是没想到余人杰被逼成那样，周新明白他的意思，纪纲提出交易条件，周新表明人生信条。
周新听完纪纲的话后感觉到奇耻大辱，他要回牢房受刑，就是死也不是屈服。段无极等周新出门后走出来，纪纲命他将周新送回京城，段无极担心后患无穷，纪纲原本没想杀害周新。思琪、雪雁和小榔头来到诏监狱准备救出周新，雪雁亮出腰牌，周新被关在甲字号牢房，他们看到受刑的周新后要救他出去，周新在劝说之下只好离开，小榔头留下假扮他。
小榔头听到有人来到后假装蒙着头睡着，牢房里被吹了毒气，小榔头中毒身亡，他成了周新的替死鬼。皇上听完梁御史的汇报后夜间亲自来到杭州，纪纲听说后马上过去，他还不知道段无极已派人弄死周新，纪纲十分吃惊，段无极自认为做的天衣无缝，还用威胁之言向纪纲说话。
大明按察使第30集剧情介绍（大结局）纪纲担心那些搜刮的珍宝被发现，他派段无极前去处理。皇上召见纪纲，刑部尚书也陪同前往，梁御史问起周新，皇上也询问起周新查案之事，纪纲将责任推在刑部尚书身上，刑部尚书汇报案情，纪纲故意不表明看法，梁御史认为此案错综复杂，疑虑重重，刑部尚书的花天酒地被皇上指责，皇上也不相信周新会知法犯法。
纪纲向皇上汇报说段无极负责看押周新，梁御史知道后十分恼火，皇上得知关押在甲字号牢房的犯人死去，但死人的是小榔头，纪纲听完马上出门查看，刚一出门就见到周新。皇上让周新为自己辩解清楚，周新提出传吴之问和余人杰上场，余人杰承认做了伪证，他拿出母亲的玉镯和亲侄儿的发辫，余人杰道出真相，吴之问也是迫于无奈。
余人杰整理的详细案卷被段无极烧毁，周新提出传人证和物证，皇上同意让众人进门，周新将祝宝贵的卷宗呈上，雪雁也为此作证，她亮出锦衣卫的标识。纪纲认为段无极一案缺少人证和物证。
周新向皇上汇报纪纲派锦衣卫从寺院里搜来的珍宝，纪纲将责任都推在段无极身上，周新知道段无极已经趁乱逃走，纪纲奉皇上之命前去抓获，梁御史和刑部尚书也替周新说好话，皇上命梁御史全权办理。周新被调往京城任副督御史，纪纲想找个地方和他谈谈，周新知道他把段无极藏了起来。
纪纲在段无极的事情上向周新道歉，他不想成为冤家对头，周新要知道段无极的下落，他能看出纪纲心里也很慌张，纪纲拉开帘布后周新看到段无极已死，周新指责他杀人灭口，纪纲相信任何人都验不出段无极的死因。周新来到小榔头坟前拜祭，他后悔当年把他从家乡带出来，周新答应他回京城后不再多管闲事，周新想起和小榔头在一起的日子。
思琪在小榔头坟前找到周新，她不打算去京城，思琪要留下来多陪小榔头几天，雪雁要跟随思琪去闯天涯，周新带家人踏上归京之路。(全剧终)